民進黨黨務改造方案很快就會通過。然而，民進黨籍資深立委林濁水卻公開表示：「這是民進黨歷年來幅度最劇烈，但也是最少討論的一次改造。因此十分令人擔心。」林委員更指出「問題是這樣多，未經釐清，廿日便要匆匆決定，實在令人憂心。」林委員又擔心又憂心，顯然民進黨的改造方案有問題。 

　　總統府祕書長陳師孟說：「三月初，開始思考總統兼任黨主席的可行性。」三月六日民進黨黨務改造小組就作成決議，由總統兼任黨主席，三月中旬民進黨黨版的改造方案也就定稿了。顯然陳總統在很短時內就已經做了兼任黨主席的決定，和所謂的不主動不拒絕的說法似乎不合。 

　　總統府祕書長表示「不介入黨務與政治承諾不同，這不是許給選民一個福利與權利上的好處，而是說明自己執政後，如何作為。」又說：「只要抓住承諾的真正用意，不再讓行政資源由黨支配，這與一般競選諾言不同。」祕書長挖空心思說出這麼複雜的話來辯解，其實還是解除不了民眾對總統違背承諾的質疑。違背承諾就是沒有誠信。同時，不介入黨務是總統超越黨派的重要精神，不只是黨支配行政資源的問題。 

　　總統府祕書長在實質問題上表示總統兼任黨主席就可以消除民進黨山頭林立的現象。這種期待極為危險，也很容易落空，因為民進黨多元化是該黨的根本特徵。祕書長又說：「當黨有了強有力的領導中心，準備有所作為，可 以讓很多觀望的社會人士與意見領袖投身到民進黨。」這種預言不只是一廂情願，提到強有力的領導中心更是有很強的反民主精神。 

　　設置三個副主席引起的爭議最多，在根本的運作上也最有問題，行政、立法、黨務三個副主席是九人小組的縮小版，可能「只是資訊交換不是決策的機制」。或者，副主席成立一個「執政」小組，駕凌在中常會之上，或者，竟是主席交代三個副主席分頭去執行總統的決策。其中立法部門的副主席情況最尷尬，很可能成為黨主席貫徹意志力直接介入國會的代理人。 

　　總統兼黨主席不是不可以，但是極為重要的決定，應該透過民主程序深入做理性討論，再慎重決定。不應該是少數在上位的做了決定，而由上而下展現陳水扁接任黨主席的強烈意願，造成形勢已定，黨眾都噤聲的態勢！