在輿論一致反對的情況下，總統府仍然要設置科技諮詢委員會、總統府核心幕僚表示總統已核定設置要點，不可能更改，副總統呂秀蓮後表示，科技諮詢委員會確定在十一月一日正式成立，並且聲稱科技諮詢委員會的功能將和中研院互補。更令人錯愕的是，呂秀蓮昨天在海洋大學竟然很不得體地說「這兩天李院長對陳總統有些撒嬌」。陳總統和呂副總統這種完全不顧輿論，後踐踏科技專業精神的行徑，正是權力的傲慢，更是愚不可及。總統府設置諮詢委員會基本上是違反總統府組織法的，總統府設置科技諮詢委員會更是破壞既有的科技行政體系。雖然呂秀蓮口口聲聲說她主持的科技諮詢委員會不做決策，只提供總統科技政策 的諮詢參考。如果委員會提供的諮詢意見總統不採納，為什麼要勞師動眾成立這個龐大的委 員會。如果提出的 諮詢意見總統接納 了，總統府不可能執行，一定交給行政院科技單位執行