總統府祕書長和親民黨祕書長舉行扁宋會前會，由於檢察單位搜索聯電案，親民黨方面有相當不滿，據說扁宋會面時間，受到聯電案影響，雙方並未敲定。據報載，親民黨祕書長秦金生表示「現在扁宋兩人會面，不符合社會期待，社會關注聯電遭到搜索案，希望政府審慎處理，避免影響台灣經濟發展。據指出，雙方決定等聯電風暴過後再舉行扁宋會」。報紙報導稱相關人士透露，秦金生與張顯耀在會中花了很長的時間「討論」聯電案，也直率地向游錫表示，「聯電案確實對扁宋會的氣氛造成影響」。相對的，據報導「正式會談前總統府秘書長游錫?接受媒體訪問時表示，陳水扁總統的態度是尊重司法，但總統也坦言『聯電案確實會對國內產業造成傷害』」。同時游祕書長向秦保證「政府一定會務實處理」，才化解親民黨的疑慮。

　　在會後，親民黨秘書長公開表示，聯電案對國內衝擊不亞於四年前的核四案，親民黨主席宋楚瑜要他向政府當局轉達親民黨的立場，盼政府能「妥善處理，消除民慮。」隔一天親民黨人士表示，主席宋楚瑜前晚與秦金生、政策中心主任張顯耀、發言人謝公秉開會時認為，聯電案凸顯兩岸政策諸多過時、跟不上時代的法令，已到需要通盤檢討的地步，扁宋會不僅有正當性，更有急迫性，盡早回應業界及社會對兩岸關係能「春暖花開」的期待。親民黨高層認為行政院長謝長廷也在游秦會後，表達「法令不切實際就應該修改」的立場，親民黨認為府院已經在用「積極、正面」的態度處理聯電案。

　　從以上摘錄聯電案影響扁宋會的情形，試圖比較精確地掌握雙方的意圖，從中可以清楚地發現民親兩黨雖小心在處理，但也顯露雙方高層對司法、政策和行政有不同的認知，甚至對於政治與司法運作的分際有很不一樣的看法。

　　府院甚至包括副總統在內都一再表示，事先並不知核檢方偵辦乃至搜索聯電的事情，不過卻也看到執政黨局高層除了一再強調司法獨立以外，但也擔心對產業的影響，甚至總統府祕書長強調「政府一定會務實處理」歸行政院長也表示修改不切實際法律的立場，據說行政院長也表示有許多人不遵守的法律本身就有問題。這些在尊重法律處理以外的談話似乎讓親民黨放心，但是這其中有行政有意干涉司法的意圖似乎若隱若現。

　　相對於民進黨高層對於聯電案與扁宋會的反應，親民黨高層似乎一直就在要求總統府和行政院處理聯電案，也可以說是以扁宋會能否實現做為籌碼要求執政當局對聯電案放手。後來，為避免被指責干預司法，後斧底抽薪式地直指政策法令過時，有問題。意圖從變更法律和政策來澈底解決聯電案。親民黨高層後來更有意，把這個問題也當作是兩岸政策來納入扁宋會議的重點之一。

　　扁政府迫切尋求和解的動機相當強，親民黨有意願和解卻也遭遇到很大的壓力。檢方偵辦聯電的事，之所以會影響到扁宋會的時程，表面上看起來是突發事件，實際上卻立即成為有實質影響的議題。親民黨藉這個議題一方面可以稍稍消除所遭遇到的壓力，在另一方面更可以順勢製造會議的兩岸議題甚至壓力。

　　民親兩黨在兩岸政策上的對立一直很嚴重，所以聯電案一出，立即就挑動了親民黨極為敏感的神經，馬上就有很大的反應。雖然把聯電案延伸為兩岸政策及執行問題看起來是親民黨擅長造勢及杯葛的作為，但仔細考量起來，兩岸產業政策確實也是根本的衝突所在。聯電案更突出了這個衝突和矛盾。從這個根本的衝突去考量扁宋會乃至扁宋和解的前景，似乎是很難樂觀的。這也顯示陳水扁有意請宋楚瑜主持兩岸事務是高明、困難而且是有很大矛盾的政治手段。要解決這個矛盾，甚至聯電案帶來的問題，應是對執政當局非常嚴峻的考驗。