面對孫震事件，行政院長郝柏村一再強調政府維護學術自由的決心。然而，就在昨天，國民黨青工會召開﹁八十年大專院校主任委員、院校長座談會﹂要求黨員校長從事黨的政治工作，而國家安全局又要藉學術的名義成立﹁中華民國對外關係協會﹂。黨政機構在目前還不自覺地從事這些對學術自由和尊嚴有損的工作，推究其原因，乃在於長期以來威權式的黨化教育精神依舊存在，而黨政決策當局又十分欠缺為推展民主所必須具有的認識和反省能力。

國安局計劃推動成立學術研究機構，基本上還是要控制學術、假借學術來達到政治上的目的。根據報導，在國安局的正式公文裡，該局指出，環顧國內學術研究單位，目前除國關中心尚可為該局所用外，該局若無突破性作法，在未來時日中，將無單位可資緩衝運用，屆時該局將陷於以學術思想自由為名戕害國家安全之思潮漩渦中。